吴三桂的种种反常举动，引起了清廷的怀疑。郝浴、杨素、魏裔介、傅弘烈、李堂、赵良栋、潘太邱、查容等人或以上疏或以密告的方式向康熙反映，吴三桂将要谋反。康熙也将三藩列为头等心腹大患，刻于宫柱之上，必欲除之尔后快。三藩有前三藩后三藩之分，前三藩指福王、唐王、桂王；后三藩指平西王、平南王、靖南王，这里指的是后三藩。康熙认为吴三桂久蓄异志，撤亦反、不撤亦反，那还不如早撤，免得三藩开支巨大，朝廷肩负极重。可他又没有抓到三藩明显的把柄，正苦于没有借口之时，三月十二日，突然接到了尚可喜乞归辽东的奏疏：
臣自衔命镇粤以来，家口日蕃。顺治十二年，曾具书请解兵权。部臣以地方未宁，俟后议。方今四海升平，臣年已七十，精力就衰，正退耕陇亩之日。伏念太宗天子时，曾赐臣以辽东海州及清阳堡等处地，今乞准臣仍归辽东，安插故土，以资养赡。计带两佐领甲兵及老犀闲丁，约二万四千有奇。沿途夫船口粮，请并议拨给。
康熙见到尚可喜的奏疏，心里乐开了花，真是想打瞌睡就有人送枕头来。他立即批准了尚可喜的请求，并撤消了平南藩。
消息传出，朝野震惊。此时吴三桂刚送走来自己六十大寿赴宴的儿子吴应熊，汪仕荣也刚从台湾回来复命。汪仕荣向吴三桂汇报了尚之信、耿精忠、郑经支持起兵反清的动向。吴三桂听了汪的汇报之后，心中又多了一分底气。他立即召来方光琛、刘玄初商量对策。“王爷，世子来密信了！”
“念！”
“是！”方献廷展信读道：
康熙阴险狡诈，企图多端，千古暴君无人能及。父王若不早决断，则祸在日厉而至深！若举兵起事，则祸在眼前而甚浅。愿：父王为汉室山河着想，思之决断也！
吴三桂：现在尚可喜突然自请撤藩，咱们撤不撤呢？
刘玄初：尚可喜个老工具搬起石头砸自己的脚。他本意是自己回辽东养老，把藩位留给尚之信。没想到康熙一不做二不休，把藩位也给撤了。他愿意撤就撤吧，我们没有须要。
方光琛：不行，王爷您也得上疏请撤。
吴三桂：为何？
方光琛：如今朝廷通告全国同意尚可喜撤藩，实际上正在下一道普遍的撤藩命令，虽未言明，但意在不言中。世子这次回来的时候就说，朝廷开始怀疑王爷了，所以我们也要主动请撤，制止怀疑。
刘玄初：康熙现在正等着咱们上疏呢，你早上把请撤的折子递上去，晚上撤藩的命令就会下来，这不是没事找事吗？
方光琛：唉，这叫先礼后兵。如果王爷请撤，康熙他不允并好言慰留，说明他还念及旧情，咱们可先缓一些日子再说；如果他挽留都没有挽留就撤了，那就说明他果真忘恩负义、卸磨杀驴，他自己就先在道义上输了。到时我们再起兵讨伐，就越发名正言顺。
吴三桂觉得方光琛说得很有原理，于是命刘玄初起草撤藩疏。
七月十三日，吴三桂也上了一道辞藩的奏疏：
臣驻镇滇省，臣下官兵家口于康熙元年迁移，至康熙三年迁完。虽家口到滇九载，而臣身在岩疆已十六年，念臣世受天恩，捐糜难报，惟期尽瘁藩篱，安敢遽请息肩！今闻平南王尚可喜有陈请之疏，已蒙恩鉴，请撤全藩。仰恃鸿慈，冒干天听，请撤安插。
今后不几天，靖南王耿精忠也向清廷上了一份奏疏：
臣袭爵二载，心恋帝阙，只以海氛叵测，未敢遽意罢兵。近见平南王尚可喜乞归一疏，已奉谕旨。优念臣部下官兵，南征二十余年，仰恳皇仁，撤回安插。
吴三桂上请撤奏疏，是先礼后兵。吴三桂究竟是清廷封的王，这么多年来又一只加官进爵，如果没有什么由头就贸然起兵，人们反而会骂他忘恩负义。
康熙才不管这些，见到吴上疏，立刻批准。他亲自下令撤藩：
王自归诚以来，克殚忠荩，戮力行间，劳绩懋著，镇守岩疆，宣劳岁久。览奏，请撤安插，恭谨可嘉。今云南已经底定，王下官兵家口作何搬迁安插，著议政王大臣等，会同户、兵二部，确议具奏。
康熙给耿精忠的批复是：
王祖父以来，世殚忠荩，戮力行间，劳绩懋著，及王封镇守，劳著岩疆。览奏，请撤安插，恭谨可嘉。今福建已经底定，王下官兵家口作何搬移安插，著议政王大臣等，会同户、兵二部，确议具奏。
撤藩是康熙既定战略，他鉴于历史上元朝被汉人推翻的教训，认为汉人掌握兵权，势必会与清政府抗衡，威胁其统治。遂三藩同撤。
吴三桂身边有四台甫姬：陈圆圆、莲儿、八面观音、四面观音。其中，莲儿是其时的风云人物。她本姓王氏，年方十七，吴三桂第一次遇见她时，是在安阜园的荷花池旁。莲儿一袭白衣，手捧玉扇。站在九曲桥上，婷婷玉立，似乎出水芙蓉一般。故得名“莲儿”。
莲儿聪慧美丽，能诗善文，琴棋书画，无一不通，是一位（太平天国）傅善祥式的才女。
这天，莲儿不知哪里来了劲头，心血来潮，问小太监借了身男人衣服，把脸蛋抹黑，自己溜到达街上了，临近中午时分，饿了，她找了一家馆子，随便找个座儿，点了碗面条，就吃了起来。过了一会儿，两个书生模样的年轻人进来了，穿过大堂，要往二楼去。店小二拦住了他们，说：“二位客官，你们请大堂坐吧。”
书生说：“大堂太吵了，我们想找个平静的单间，谈些事情。”
“呃，欠美意思，二位，二楼满座了今天。”
“这才什么时辰呀，就满了，不行能吧。”二位书生拔脚就想上楼看看。
店小二用身子挡在楼梯口，犷悍地说：“我说满了就是满了，爱吃吃，不吃走人！”
二个书生见状，只好悻悻地到大堂里坐下了。
没过一会，一个满脸横肉、腿短脖粗的满洲大员进来了，梳着大波辫，马褂旗袍，冲着店小二说了几句听不懂的满话，店小二立刻颔首哈腰，道：“爷，楼上请，楼上请！”
回来之后，莲儿就不干了，嘟着嘴在那哭，怎么哄也哄欠好。金项链？不要。银镯子？不要！把吴三桂急的。
“王爷，你在明朝也是做王，在清朝也是做王。同样是做王，干嘛流芳千古的不做，非要做那遗臭万年的呢？”一句话，把吴三桂噎得不知道该怎么回覆：“宝物儿，等准备好了，咱明儿个就反清复明！”这才给哄住。
过了一段时日，莲儿见吴三桂还没消息，气得咬破了手指，上了封血书给吴三桂：
伏以大王起家武功，世受明恩，父子相继，得专藩政。在先朝厚泽深仁，至矣尽矣！天祸朱明，闯，献迭起，神京破陷，龙驭宾天。大王当国破家亡之际，只坐视以贻误事机。迨事势不行为，始借力外人，以伸一时之忿，此大王之深误也。当敌军既进，神京亦亡，国号迁移而有天沉，地惨之变，大王不于此时召人心，以佑明室，复为敌驰驱，马足纵横于汴梁、川、楚之间，爱及缅甸。此时此际，明裔固亡，汉祀亦斩，此又大王误之又误者也。
大王既树不世之勋，以开国元良为封藩开府，南面称孤，荣亦极矣。乃浩劫甫平，怀疑遽起，昔人所谓“狡兔死，走狗烹，飞鸟尽，良弓藏”者，其在此乎？今大王如欲保功名，存富贵，自可卸兵权，终老林下，宁受万年之唾骂，犹得一时之空闲，此范蟸与医生种之事，可为前车也。然或嫌疑未释，则孤身远引，其势益危，大王苟不能低首下心，抑早为之计，迁延罡日，噬脐之悔，岂复忍言。今大王溺于晏安，不知发愤，萧墙之祸，将有不行胜言者。语曰：“改邪归正，立地成佛。”愿大王勿河汉妾言，此则大王死里求生之时机也。伏唯大王图之。莲儿泣血拜上
吴三桂一看吓坏了，慌忙把他的起兵计划透露了一些，这才作罢。