建武元年刘秀称帝后不久，十月即派傅俊前往南阳接来姐姐湖阳公主刘黄，妹妹宁平公主刘伯姬。以及原配妻子阴丽华，封她为朱紫。因为阴氏雅性宽仁，光武帝曾一度想立她为后，但被阴丽华很是坚决地拒绝了。她体现，郭氏与刘秀有困厄之情，并生有儿子。因此固辞后位。
建武二年春正月（公元26年），郭圣通的舅舅真定王刘杨私下与绵曼贼交通，有谋反之意，光武帝遣骑都尉陈副、游击将军邓隆讨伐刘杨，刘杨却闭城门不应。光武帝又派遣前真定上将耿纯，持节杖，名义上去幽、冀行使赦令，劳慰当地王侯。实际上秘密下令：“刘扬若见，因而收之。”
耿纯的母亲是真定宗室之女，抵达真定后，只带百余名兵士，住在传舍，邀刘杨相见。刘杨自恃人众势强，便应邀前往传舍。见到刘杨和刘让兄弟两人后，耿纯乘隙诛杀二人。“扬入见纯，纯接以礼敬，因延请其兄弟，皆入，乃闭合悉诛之，因勒兵而出。真定震怖，无敢动者。帝怜扬、让谋未发，并封其子，复祖国。”光武帝复封刘杨之子刘得为真定王，刘让之子为临邑侯。
于建武二年六月，光武帝正式封爵朱紫郭圣通为皇后。其宗子刘彊被立为太子，并大赦天下，普天同庆。在诞育太子刘彊之后，她又陆续为刘秀生下了刘辅，刘康，刘延，以及刘焉四位皇子以及刘红夫公主。
刘秀早年对身为宗子的太子刘彊照旧一个奶孩子的时候，光武帝以王丹为太子少傅，王丹资性方洁，疾恶强豪，曾经资助邓禹西征，由此邓禹举荐委职左冯翊，而王丹最终拒绝任职，其后被征为太子少傅。统领太子官厅，后又进为太子太傅，而此时，申屠刚向光武帝提出，要求太子就东宫，申屠刚的奏请遭到了天子的严厉拒绝。也因此遭贬。建武七年王丹逊位，又由陇右张湛任太子太傅。
与此同时，与张湛同属陇右的郑兴因为郭伋迟迟不能受任大司空而犀利的向光武帝提出“用元勋而人位谬”，直接揭露了之后郭伋在建武十一年所说的朝廷专用南阳人的本质。而作为陇西圈的张湛，郑兴，郭伋，以及日后担任刘强东海王傅，后任大司空的杜林，从一开始，就和南阳元勋团体，成拉锯之势，这种拉锯，直至建武十三年（公元37年），以陇西幕府的最高主座窦融的低调入朝而变得越发暗潮涌动。
公元38年郭况迁城门校尉，其后，郭圣通数怀怨怼。这一点在后汉书天文志上获得了十分具体的体现，金犯轩辕大星，轩辕者，后宫之官，大星为皇后，金犯之为失势。是时郭后已失势见疏，失势为忧丧。郭氏无丧却有忧，政局中南阳河西拉锯。随着河西大佬[1]窦融的低调缄默沉静而基本失去平衡，以及郭皇后的徐徐失势，皇太子刘疆的河西辅臣团体徐徐势弱。