阿尔萨斯端木领导着黑羽舰队到来，一万艘玄色无光的森然战舰，排列在十万艘智械军团战舰后面，就在这时，智械军团所有战舰停止了运行。
一晃二十年已往，李林，瓦西里，陈星海，申如花和卓尔那兰，成为了新的星际舰队大舰队长，令狐稳继续阿尔萨斯的位置，开始了越发前沿的科学研究，托勒密接替冷云，成为突击军团总指挥官，自从二十年前太阳系危机以来，人类进步了许多，齐洛在最要害一刻，停止了智械军团主脑运行，并损失自身意识，转化了智械主脑的全部法式，当智械军团重启以后，迅速资助人类开始重建家园，并收拢全部可以控制的舰队，总计三十万新式仿生战舰，配合另一个到达人类控制星域的高级文明，和星际舰队一起打败了曾经控制它的高级文明势力，保持了整个银河的宁静。
齐洛的同伴们有的选择隐居，有的飞向宇宙，新生的智械军团主脑和塞拉尔行星一起革新，两颗行星装置了大型助推器，开始了一起在宇宙流浪旅行，令狐稳领导团队掌握了空间锁定技术，同时也学会了虫洞缔造和稳定技术，实现了人工虫洞和牢固星门制作，人类的飞船自此可以更快的飞向深空宇宙。
由于和智械军团的战争，导致人类原先控制的星域资源大幅度淘汰，新的行星革新技术不停降生生长升级，人类战舰已经可以不用矿物质，仅仅依靠生物质转换就可以实现结实船体和能量运用，和其他高级文明的交流让人类意识到宇宙的辽阔和深邃，随着科技再次发作，人类生命也极大提高，意识能量开始认知，徐徐理解了传说中修仙文明的本质和本源，最终走向了长达千年的和谐共生，未来，幸福美满。