名侦探柯南漫画主线话数如下:
第1话: 名侦探柯南的真相
第2话: 小学生的可疑行为
第3话: 黑暗组织的眼睛
第4话: 柯南VS基德
第5话: 神秘搭客
第6话: 目标是小五郎
第7话: 侦探们的夜话
第8话: 白色巨塔
第9话: 绝密的任务
第10话: 追踪者
第11话: 法庭的谜团
第12话: 犯罪的疑团
第13话: 都市之光
第14话: 名侦探柯南 满月之夜的二元神秘事件
第15话: 柯南与平次的推理
第16话: 迷宫的十字路口
第17话: 目标是小五郎
第18话: 侦探们的激斗
第19话: 绝密的委托
第20话: 缄默沉静的羔羊
第21话: 追踪消失的钻石
第22话: 小学生与大侦探
第23话: 黑暗组织的行动
第24话: 小五郎的推理
第25话: 侦探们的 K 计划
第26话: 追踪监犯的要领
第27话: 名侦探柯南 同时进行的推理
第28话: 红色的满月
第29话: 生死一瞬间
第30话: 推理的激斗
第31话: 柯南的解决
第32话: 绝不能绝不能忘记的事情
第33话: 黑暗组织的影子
第34话: 世纪末的魔术师
第35话: 目标是小五郎
第36话: 侦探们的推理
第37话: 推理的对决
第38话: 侦探们的战栗
第39话: 绝望的追踪
第40话: 名侦探柯南 真相的探究